Son más o menos equivalentes, aunque la segunda podría estar dando a entender que son buenos como persona, en su comportamiento humano, mientras que la primera podría referirse más bien a su rendimiento en cuanto a los contenidos que se enseñan ("sacan diez en matemáticas"). Es concebible que "un buen alumno" en el primer sentido sea a la vez una porquería de persona (psicopatea a sus compañeros, les hace bullying, vende drogas en el baño, etc.) :D

Si existiera esta diferencia de sentido, debería estar marcada por el contexto. Si no, son más o menos intercambiables

Significan lo mismo, con el matiz de que la primera es un poco más enfática y por eso suena un poco más elogiosa.

¡Muchas gracias!